平叛结束后，明廷论功行赏，朱大典因功被晋升为兵部右侍郎，还被赐予了锦衣卫百户的世荫，让子孙后代都能享受朝廷的恩惠。在山东任上的出色表现，让朱大典深受明廷的信任。后来，他被派往凤阳长期镇守，总督江北及河南、湖广的军务，成为了手握重兵的封疆大吏。
也正是在镇守凤阳、执掌漕运及江南三地巡抚事务的这段时间里，朱大典被人扣上了“贪官”的帽子。当时，给事中方士亮、御史郑昆贞等人接连上奏弹劾朱大典，指责他“不能持廉”，说他“性奇贪，多行暴虐”，利用职权大肆搜刮钱财，将管辖范围内四府的僚属钱财尽数榨取，甚至有人夸张地说他“富可敌国”。在这些官员的弹劾下，朝廷下旨将朱大典革职候审，一时间，朱大典成了朝野上下人人唾骂的“大贪官”。
可谁也没有想到，就是这个被骂作“严嵩再世”的“大贪官”，在南明时期，却爆发出了令人震撼的正能量，用生命诠释了什么是“忠臣义士”，什么是“民族气节”。史书中用“婴城守婺，破家从忠，继之以死”这九个字，高度概括了他最后的悲壮历程。坚守婺州（金华），倾尽家产资助义军，最终以身殉国。
清军大举南下后，南明政权节节败退，南京很快失陷。朱大典见大势已去，却没有选择投降，而是率领残余的将士退回了自己的家乡金华，据守府城，决心与清军死战到底。清军统帅博洛得知朱大典据城顽抗，心中不以为然。他知道朱大典以“贪污”闻名于世，便认为这样的人必定贪生怕死，只要一纸招降书便能将其摆平。于是，他命令已经投降清军的大才子阮大铖，给朱大典写一封招降信。
博洛的想法很好，可结果却大大出乎他的意料。朱大典收到阮大铖的招降信后，连看都没看完，便当场将信撕碎，还下令将送信的使者斩杀，以此表明自己誓死不降的决心。朱大典的举动彻底激怒了博洛，他亲自统率满汉大军，向金华城发动了狂风暴雨般的猛攻。
可博洛万万没有想到，朱大典的军事指挥能力竟然如此出色。他凭借着金华城的坚固防御，指挥着自己招募来的义军，从容不迫地应对清军的进攻。这场攻防战足足持续了二十多天，清军发起了一次又一次的冲锋，却始终无法攻破金华城，反而死伤无数，将士们个个望城却步，再也不敢轻易发起进攻。
说来令人唏嘘，
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