长安之后，他因为正经正解的争论和辩解，开始重新审视自己之前的一些经文的注释，开始从原始的天人感应理论当中摆脱出来，逐渐的从唯心走向唯物。
郑玄渐渐的开始强调人的主观能动作用，表示只要按照有序的安排，按照客观规律行事，那么就可以得到好的结果，并且不再特别强调那些什么祥瑞之事。
这样的转变，是因为郑玄的政治立场的变化。
郑玄原先在政治立场上，是偏向于保守和正统的，他认为封建制度是合理的和永恒不变的，符合天意的，因而积极维护封建统治的中央集权制，反对地方割据势力，所以郑玄当时非常厌恶袁绍，也不喜欢曹操。
不过现在，郑玄虽然同样也反对地方割据势力，但是他同样也意识到，并非所有的地方割据势力都是残害百姓的，都是乱世的祸根……
尤其是斐潜在取得了关中稳定之后，并没有大举进攻山东，而是依旧对天子表示遵从，虽然郑玄也明白这只是表面上的遵从，但也足够让郑玄大感欣慰。
因为郑玄从根本上，还是认同汉室的，他认为作为人臣，至少必须具备三德之一，忠义勇，不可全无，若是全无那就根本不够资格作为一个臣子。所以在郑玄的整体事项理论当中，虽然现在被剔除了谶纬的部分，也不再强调神灵和祥瑞等事，但是在对待君臣关系，治理百姓等制度上，郑玄依旧认为是要严守等级秩序，才可使政治稳定，风调雨顺，国泰民安。
而对于司马徽来说，他认为斐潜现在做的就很好。
司马徽认可的政治制度和郑玄完全不同。
简单来说，司马徽认为朝堂距离地方太远了，朝堂的责任是只需要管理好各地大员即可，但是不应该制定一些没卵用的政策去捆绑各州郡的手脚。
而且从某个角度上来说，汉代的朝堂么，也确实做得不怎么样……
『庙堂……好好，既然郑公说庙堂，那就说庙堂……』司马徽捋着胡须说道，『昔日孝顺帝崩，冲帝始在襁褓，庙堂何为之？求请太后临朝尔，太后又是何为？诏冀与太傅、太尉参录尚书事。冀身居高位，权掌朝堂，却侈暴滋甚。后孝冲帝又崩，冀立质帝。帝少而聪慧，知冀骄横，尝朝群臣，目冀而恶语，然朝堂之内大臣何为之？呵呵，任由跋扈进鸩，帝即日崩。』
『后孝桓帝即位，亲宦官而远
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